Sinopse: No ano de 1939, a humanidade estava à beira da destruição. Equipado com armas de poder devastador, uma misteriosa raça alienígena, conhecida como Neuroi, iniciou uma invasão da Terra, devastando o planeta, destruindo países e derrotando exércitos humanos. Para combater essa força aparentemente imparável, as potências do mundo se uniram. Foi produzido um novo dispositivo, denominado Striker Unit, capaz de enfrentar a tecnologia Neuroi. Meninas equipadas com a Unidade Striker ficaram conhecidas como as Bruxas, formando a última linha de defesa da humanidade. Eles começaram sua luta contra os Neuroi, utilizando suas habilidades mágicas agora aprimoradas, exibindo armas destrutivas que nenhum humano poderia controlar. Avançando para 1944—Yoshika Miyafuji é uma jovem adolescente que eventualmente decide se juntar à 501ª Ala de Caças Conjunta, conhecida como as "Bruxas do Ataque". Sem treinamento formal, no entanto, Miyafuji pode aprender a cooperar com seus colegas Strike Witches? E se sim, ela pode salvar a humanidade do ataque dos Neuroi?